支原体、衣原体感染人体后，首先侵入柱状上皮细胞并在细胞内生长繁殖，然后进入单核巨噬细胞系统的细胞内增殖。由于支原体、衣原体在细胞内繁殖，导致感染细胞死亡，同时尚能逃避宿主 防御功能，得到间歇性保护。支原体、衣原体的致病机理是抑制被感染细胞代谢，溶解破坏细胞并导致溶解酶释放，代谢产物的细胞毒作用，引起变态反应和自身 。

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    解脲支原体破坏生精细胞：睾丸的曲细精管中有大量生精细胞，这些生精细胞经过发育繁殖形成精子。当支原体从尿道、前列腺等部位进入睾丸曲细精管后，会破坏生精细胞，使精子质量、数量下降，进而导致 育。

    解脲支原体使精子畸形率增加：支原体感染导致精子畸形率增加是造成 育的另一特征。据临床观察，在这类 育患者中，精子畸形率有时可高达80%。

    继发生殖器炎症， 精子质量，导致 育：支原体还继续感染精道、精囊和睾丸， 精子和精液的质量，引起 育。经观察发现支原体可通过下述环节引起 育症。

    解脲支原体 精子运动：精子运动是健康精子的一项重要功能，是衡量精子能否受孕的重要指标，而且精子的运动必须有一定速度和频率。支原体感染精子后，常常附着在精子的头部和尾部，使整个精子挂满了大小 等的附着物，致使精子泳动 力，互相缠绕，导致 育。

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    导致尿道炎并继发前列腺炎：支原体经尿道感染后患者可出现尿道炎症状，并可继发慢性前列腺炎。在检查前列腺液时，可见活泼、泳动的微生物群体。

    支原体感染还可以通过间接接触感染，因为支原体衣原体可以通过飞沫传播，接触或支原体衣原体感染患者使用过的衣物、坐便器、脸盆、毛巾等感染的。